Родилась 12 августа 1831 в г. Екатеринославе (ныне Днепропетровск) в семье иммигранта из Германии. В числе ее предков были представители знатных исторических родов Франции, Германии и России.
В детстве была слабым и болезненным ребенком. По мнению окружающих, обладала сверхъестественными психическими способностями, всегда стремилась к независимости и свободе.
Еще до достижения совершеннолетия вышла замуж за эриванского вице-губернатора Никифора Блаватского, человека намного старше ее. Через три месяца после свадьбы оставила мужа.
С 1848 по 1872 много путешествовала по миру. За 24 года побывала в Африке, Центральной Азии, Южной Америке, Индии, Восточной Европе и других местах, где в те времена еще не бывали европейцы.
В 1853 переехала в Англию, но вскоре снова отправилась в путешествия.
С 1858 по 1863 жила у родственников в Одессе и Тифлисе. До 1858 трижды предпринимала попытку проникнуть в Тибет, но все они не увенчались успехом. За тайное проникновение в Тибет иностранцам грозила смертная казнь. В 1864 это ей, наконец, удается, и она снова отправляется разъезжать по миру.
В 1873 переезжает в Америку.
7 сентября 1875 Блаватская открывает первое Теософское общество, задачами которого являются достижение всемирного братства людей, изучение восточной мудрости, исследование законов природы и человеческой психологии.
В 1877 в Нью-Йорке Блаватская опубликовала книгу «Разоблаченная Исида», которая обратила на себя внимание «вызовом догматизму религии и современной науке».
В 1878 основатели Теософского общества переселились в Бомбей.
С 1884 по 1891 Блаватская жила в Европе. В этот период ею были написаны книги «Тайная доктрина», «Ключ к теософии», политические и этнографические статьи, рассказы о своих путешествиях.
Основала важнейшие теософские журналы – английские «Theosophist», «Lucifer» и французский «Lotus blеu».
Скончалась 8 мая 1891. Этот день последователи теософского учения во всем мире отмечают как «День белого лотоса».